SRAからfastqをダウンロードする時の関連知識
更新: 2022-05-20
SRAからfastqファイルをダウンロードする時の関連知識
更新: 2022-05-20
SRAからfastqファイルをダウンロードする時の関連知識
更新: 2022-05-20
GO解析はよく使われる解析手法ですが、正確に理解するには、まずGOそのものに関する理解が必要になります。GO Termの基本についてまとめていきます。
更新: 2022-05-20
httpやftpによるSRAへのデータアップロードは遅すぎるので、IBMのaspera connectを使ってデータをアップロードするやり方を使おう。
更新: 2022-05-20
自然言語処理技術では深層学習技術が非常に良い成果をあげています。タンパク質配列からGO Termなどのアノテーション行い、機能を推定する方法として、これまでの多くはBLASTなどの相同性検索を用いていました。最近では、いくつかのツールが深層学習ベースで機能予測を行っています。今回はdeepgoplusを試してみることにします。