CellRangerでSTARのパラメータを変更する

作成

2022-05-20

更新

2022-05-20

single cell RNA-seqを知ってる人ならまず知っているであろう、Cell Ranger。使ったことがなかったんですが、ちょっと使ってみようかなと思いました。しかし、これ内部的にはSTARを使ってマッピングするんですが、STARのパラメーターを引数でとれない、という問題(誰も問題にしていない)があります。公式の解答としては、自分でビルドしてね、責任は持たないけど、ってことらしいです。