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rust-bioを使ってfastq/fastq.gzを読み書きします。

published: 2020/12/25 update: 2021/9/24

salmonの出力ファイルはquant.sfですが、その加工は非常に多岐に渡り、結構難しいです。tximportで加工できる先と用途についてまとめていきたいと思います。

published: 2021/1/19 update: 2021/9/24

httpやftpによるSRAへのデータアップロードは遅すぎるので、IBMのaspera connectを使ってデータをアップロードするやり方を使おう。

published: 2021/9/11 update: 2021/9/24

NGSライブラリ調製の際には多様な反応が使用されている。それらのうち、知っているものについて原理をまとめていきたい。

published: 2021/1/3 update: 2021/9/24

次世代シーケンサーの解析って言ってもピンとこない人が多いような気がするので、知識の整理も兼ねてその辺から軽く書いていこうと思います。生物わかんない人にわかるように頑張ろうと思います。

published: 2021/1/3 update: 2021/9/24

次世代シーケンサー(NGS)解析技術の発展に伴い、比較的安価にシーケンスを行うことができるようになってきています。NGS解析を行うにあたって重要なライブラリ調整の原理と、シーケンサーの挙動についてまとめていきます。

published: 2021/6/21 update: 2021/9/24

コードを書くときに書いてる言語が何なのか表示すると、見るときに便利です。CSSだけで実現できます。

published: 2021/6/27 update: 2021/9/24

JavaScriptのランダムは非常に使い勝手が悪いので選択肢とか、よく使う関数などのまとめです。

published: 2021/7/15 update: 2021/9/24

Python、特にmatplotlibで作成したPNGファイルをJSONにSerializeしてフロントエンド側に送りたいときにどうすればいいのかについて

published: 2020/9/24 update: 2021/9/24

Wordpressでブログを作っていたが、パフォーマンスが遅いのでNext.jsで作り直した。ほしい要件、使うフレームワークの選定など。

published: 2020/9/7 update: 2021/9/24

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