Profile
経歴・学歴・論文
経歴書
川村昇吾（Shogo Kawamura）は、分子生物学とバイオインフォマティクス、およびソフトウェアエンジニアリングを専門とする。京都大学農学部を卒業後、同大学院生命科学研究科で分子生物学を専攻し、2023年に博士号を取得した。博士課程在学中は日本学術振興会特別研究員（DC2、2021年〜2023年）に採用され、科研費「陸上植物における植物ホルモン・ジベレリンを介した生殖細胞分化機構の解明」（課題番号21J15550）に取り組んだ。
主要な研究成果は、公開データベース MarpolBase および MarpolBase Expression の開発と、ゼニゴケ Marchantia polymorpha がもつ祖先的なジベレリン関連経路の解明であり、後者では SABATH ファミリー酵素が同経路を介して発生を制御することを示した。関連する研究として、GRAS 転写因子がジベレリン関連化合物を介して遠赤色光応答を担うことの解明、性決定因子の同定、深層学習を用いた形態変異の解析にも携わり、成果は The Plant Cell、Current Biology、Cell Reports、Plant and Cell Physiology 等の学術誌に発表されている。
2023年より Preferred Networks でリサーチャー／エンジニアとして機械学習に関する研究開発に従事するかたわら、ゼニゴケ類のゲノム解析プロジェクトにも共同研究者として参加を続けている。
職歴
Preferred Networks (Japan)
2023-10 — 現在Japan Society for the Promotion of Science
2021-04 — 2023-09Kyoto University
2020-04 — 2023-09
学歴
Kyoto University
2020-04 — 2023-09Doctor of Biostudies
Kyoto University
2018-04 — 2020-03Master of Biostudies
Kyoto University
2014-04 — 2018-03Bachelor of Agriculture
論文
Eita Shimokawa, Maiko Okabe, Rui Sun, Shogo Kawamura, Yoshihiro Yoshitake, Yukiko Yasui, Shohei Yamaoka, Kiyoshi Mashiguchi, Shinjiro Yamaguchi, Takayuki Kohchi
The Plant Cell
DOI: 10.1093/plcell/koag188Yasuhiro Tanizawa, Takako Mochizuki, Masaru Yagura, Mika Sakamoto, Takatomo Fujisawa, Shogo Kawamura, Eita Shimokawa, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, John L Bowman, Frédéric Berger, Katsuyuki T Yamato, Takayuki Kohchi, Yasukazu Nakamura
Plant and Cell Physiology
DOI: 10.1093/pcp/pcaf159Cited by 13Shogo Kawamura, Eita Shimokawa, Maika Ito, Isuzu Nakamura, Takehiko Kanazawa, Megumi Iwano, Rui Sun, Yoshihiro Yoshitake, Shohei Yamaoka, Shinjiro Yamaguchi, Takashi Ueda, Misako Kato, Takayuki Kohchi
DOI: 10.64898/2025.12.11.693594Insights into convergent evolution of cosexuality in liverworts from the Marchantia quadrata genome
2025Giacomo Potente, Yukiko Yasui, Eita Shimokawa, Jerry Jenkins, Rachel N. Walstead, Jane Grimwood, Jeremy Schmutz, Jim Leebens-Mack, Tomas Bruna, Navneet Kaur, Raymond Lee, Sumaira Zama, Tomoha Tanaka, Yuka Umeya, Shogo Kawamura, Katsuyuki T. Yamato, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masaki Shimamura, Takayuki Kohchi, Péter Szövényi
Cell Reports
DOI: 10.1016/j.celrep.2025.115503Cited by 4Yoko Tomizawa, Naoki Minamino, Eita Shimokawa, Shogo Kawamura, Aino Komatsu, Takuma Hiwatashi, Ryuichi Nishihama, Takashi Ueda, Takayuki Kohchi, Yohei Kondo
Plant And Cell Physiology
DOI: 10.1093/pcp/pcad117Cited by 9Shogo Kawamura, Facundo Romani, Masaru Yagura, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Yasukazu Nakamura, Katsuyuki T Yamato, John L Bowman, Takayuki Kohchi, Yasuhiro Tanizawa
Plant and Cell Physiology
DOI: 10.1093/pcp/pcac129Cited by 77Sakiko Ishida, Hidemasa Suzuki, Aya Iwaki, Shogo Kawamura, Shohei Yamaoka, Mikiko Kojima, Yumiko Takebayashi, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Hitoshi Sakakibara, Takayuki Kohchi, Ryuichi Nishihama
Plant and Cell Physiology
DOI: 10.1093/pcp/pcac004Cited by 61Miyuki Iwasaki, Tomoaki Kajiwara, Yukiko Yasui, Yoshihiro Yoshitake, Motoki Miyazaki, Shogo Kawamura, Noriyuki Suetsugu, Ryuichi Nishihama, Shohei Yamaoka, Dierk Wanke, Kenji Hashimoto, Kazuyuki Kuchitsu, Sean A. Montgomery, Shilpi Singh, Yasuhiro Tanizawa, Masaru Yagura, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasukazu Nakamura, Chang Liu, Frédéric Berger, Katsuyuki T. Yamato, John L. Bowman, Takayuki Kohchi
Current Biology
DOI: 10.1016/j.cub.2021.10.023Cited by 78
Data from ORCID (fetched: 8/18/2026)