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深層学習ベースのGO termアノテーションを試してみる

自然言語処理技術では深層学習技術が非常に良い成果をあげています。タンパク質配列からGO Termなどのアノテーション行い、機能を推定する方法として、これまでの多くはBLASTなどの相同性検索を用いていました。最近では、いくつかのツールが深層...

published: 2021/4/11 update: 2021/4/11

競技プログラミングに関するメモ

競技プログラミングに関する自分用のメモ

published: 2021/1/13 update: 2021/4/11

matplotlibでcolorbarのみplotし、ある値がどの色になるのか判定する

matplotlibを使っていて、colorbarだけ作りたいとき、そして作ったcolorbarに対して、ある値がどの色になるのか知りたい、というニッチな状況への対応策

published: 2020/9/25 update: 2021/4/11

salmonの出力ファイルをtximportで加工する

salmonの出力ファイルはquant.sfですが、その加工は非常に多岐に渡り、結構難しいです。tximportで加工できる先と用途についてまとめていきたいと思います。

published: 2021/1/19 update: 2021/2/17

DjangoでPylanceがimportを解決しない問題の対処法

Pylanceは非常に優れたコーディング支援拡張機能ですが、importがよく解決されなくて困っていました。小規模開発のときはまあいいか、と思ったりするのですが、djangoとかで解決されないと結構手間なので、解決法を調べたら解決したので書...

published: 2021/2/17 update: 2021/2/17

Github Actionsとcrossを使ってReleaseでクロスコンパイルしてバイナリをアップロードする

Github Actionsとcrossを使ってReleaseでクロスコンパイルしてバイナリをアップロードする

published: 2020/10/8 update: 2021/1/19

Rustのデータフレームcrateのpolarsとpandasの比較

rustにも実はpandas likeなcrateがあることを知ったのでpandasとの対応関係をまとめてた。最善である保証はありません。

published: 2021/1/9 update: 2021/1/9

RustでDFSとDFS木

rustで木上のDFSとDFS木

published: 2021/1/3 update: 2021/1/6

JSONで画像をやりとりする python <-> JavaScript(React)

Python、特にmatplotlibで作成したPNGファイルをJSONにSerializeしてフロントエンド側に送りたいときにどうすればいいのかについて

published: 2020/9/24 update: 2021/1/6

NGSライブラリ調製の時に使用される反応まとめ

NGSライブラリ調製の際には多様な反応が使用されている。それらのうち、知っているものについて原理をまとめていきたい。

published: 2021/1/3 update: 2021/1/3

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